Pokémon the Movie: I Choose You! es bastante distinta de la serie original reemplazando a los dos compañeros de Ash con personajes nuevos. Reporta Kotaku que el protagonista ya no vivirá sus aventuras junto a Brock y Misty, sino que según el sitio oficial, estarán Souji.

Brock y Misty no están incluidos en la lista de personajes que aparecerán en la película, pero vuelve a narrar la triste escena en donde Ash se despide de Butterfree, pero sin sus amigos.

Sin embargo, éstos y otros protagonistas serán presentados al final de los créditos. De acuerdo al usuario de Twitter, Alex Aniel, este elemento incluye a Brock y Misty, al igual que a Tracey, May, Max, Dawn, Iris, Cilan, Serena, Clemont y Bonnie.

También se menciona que el equipo Rocket será presentado, aunque su participación en la narrativa será corta.